Od 1 stycznia 2004 r. chorzy mieli zapewnioną pełną refundację przez NFZ sprzętu stomijnego oraz środków pomocniczych służących do pielęgnacji stomii, co dawało im szansę na w miarę normalne funkcjonowanie. Niestety, od 2010 roku Ministerstwo Zdrowia i Narodowy Fundusz Zdrowia zamierzają wprowadzić częściową odpłatność za sprzęt stomijny. Ta decyzja spotkała się ze sprzeciwem ze strony pacjentów ze stomią oraz opiekujących się nimi lekarzy i pielęgniarek. Janusz Kochanowski podkreśla, że „wprowadzenie projektowanych zmian może zdecydowanie pogorszyć jakość życia około 40 tys. pacjentów, u których z powodu choroby nowotworowej, przewlekłych chorób lub wad wrodzonych przewodu pokarmowego i układu moczowego zaszła konieczność wykonania czasowej lub trwałej stomii".

Rzecznik twierdzi również, że według posiadanych przez niego informacji pogarsza się jakość opieki nad chorymi ze stomią. Liczba poradni stomijnych jest ograniczana, a pacjenci przekazywani są do poradni chirurgicznych. W związku z tą sytuacją J. Kochanowski w piśmie do E. Kopacz zwrócił się także z prośbą o udzielenie informacji w sprawie poprawy organizacji i jakości opieki medycznej nad pacjentami ze stomią.